BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) ialah algoritma yang digunakan untuk mengira persamaan jujukan antara jujukan biologi, seperti jujukan nukleotida DNA dan jujukan asid amino protein.[7] BLAST ialah alat untuk mencari jujukan yang serupa dengan jujukan pertanyaan dalam organisma yang sama atau dalam organisma yang berbeza. Ia mencari urutan pertanyaan pada pangkalan data dan pelayan NCBI, dan menyiarkan keputusan kembali ke penyemak imbas orang itu dalam format yang dipilih. Urutan input kepada BLAST kebanyakannya dalam format FASTA atau GenBank manakala output boleh dihantar dalam pelbagai format seperti HTML, pemformatan XML dan teks biasa. HTML ialah format output lalai bagi halaman web NCBI. Keputusan untuk NCBI-BLAST dibentangkan dalam format grafik dengan semua carian ditemui, jadual dengan pengecam jujukan bagi carian yang mempunyai data berdasarkan pemarkahan, bersama dengan penjajaran untuk jujukan diingini dan carian yang diterima dengan skor BLAST analog untuk ini.[8]